醫工結合主要是聯合國內醫院開展適宜技術與產品開發，推動醫院的創新思想和工程技術緊密結合，促進臨床需求和技術創新融合發展。重點支持醫療儀器與試劑的研發，分為分為基礎類項目與開發類項目。
1）基礎類項目主要對已有系統、儀器等進行方法學研究及驗證，需要醫生為臨床試驗等提供便利。
2）開發類項目主要是圍繞臨床需求，以醫生的原創想法為牽引，結合已有的技術基礎，開發出新的儀器或試劑等，或是將已有儀器設備進行更新升級。
項目的成果形式包括（但不限于）：文章、專利、實驗系統、原理樣機、試劑、軟件等。
專項設立以來，已先后與吉林大學第一醫院、復旦大學附屬華山醫院、復旦大學附屬中山醫院等20多家醫院簽訂合作協議，共建研發機構、定期交流、聯合申請國家項目；建立知識產權體系保護醫生權益；建立獎勵與股權激勵機制等。
